Naar eigen zeggen versleutelt Skype gesprekken met 256 bit AES sleutels, waardoor het zelfs voor grote regeringsinstanties als de Amerikaanse NSA met bekende technieken niet mogelijk is om een gesprek snel te kraken, laat staan de miljoenen die dagelijks via de software worden gevoerd. Moederbedrijf eBay spreekt de berichten niet tegen. Op vragen van de redactie reageerde de persvoorlichter van moederbedrijf eBay met: "Skype reageert niet op speculaties in de media."
Vermoedens over een mogelijke achterdeur in Skype zijn er al langer aangezien de fabrikant het gebruikte protocol en de precieze werking van de client niet uit de doeken wil doen, blijft onduidelijk wat Skype verder aan mogelijkheden biedt en welk risico je bijvoorbeeld bij gebruik binnen een bedrijf loopt.